Systém klade velký důraz na bezpečnost. Data jsou chráněna především svým uložením v databázovém serveru Oracle, vyžadujícím prokazování oprávnění k přístupu jménem a heslem. Vzdálená komunikace uživatelů se systémem je šifrována.

Jednotliví uživatelé mají přidělena individuální přístupová práva ke konkrétním funkcím systému nebo jsou zařazeni do uživatelských rolí s příslušnými oprávněními. Uživatel bez příslušných oprávnění nemůže ani z aplikace ani pomocí jakéhokoli vnějšího připojení k systému příslušnou funkci systému použít.

Všechny aktivní operace (tj. zadávání faktur) musí být podepsány klíčem klienta.